Ingénieur / Ingénieure de recherche scientifique (H/F)

💼 Offre d'emploi

Date de publication

23/10/2026

Dernière mise à jour

24/10/2026

Type de contrat

CDD - 12 Mois

Durée de travail

Expérience

Débutant accepté

Salaire brut

à partir de 3143,64€ selon expérie.

Permis demandé

Aucune information

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📍 Entreprise

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Description de l'offre

Mission :
L'ingénieur aura pour mission principale de définir et développer un pipeline d'analyse de données de métabarcoding pour le traitement des données générées dans le cadre du PEPR Dynabiod :

- Définir le pipeline en collaboration avec l'ingénieur responsable de l'encadrement et les autres membres du projet.
- Développer le pipeline en Nextflow en privilégiant la réutilisation de composants déjà existants (nf-core) et en apportant un soin particulier à la modularité.
- Evaluer les performances tant en terme de ressources informatiques nécessaires qu'en terme de fiabilité des résultats obtenus

Activités :
- Veille scientifique et bibliographique pour la définition du pipeline et de ces différentes étapes.
- Développer le pipeline à l'aide de Nextflow mais également, si nécessaire, des scripts de traitement pour les étapes internes du pipeline (bash, python et R)
- Documenter les développements, rédiger des tutoriaux et assurer un support technique aux utilisateurs
- Communiquer et valoriser les résultats auprès de la communauté scientifique (présentations lors de réunions du consortium, conférences ou workshops, participation à la rédaction des publications scientifiques valorisant les outils développés)